অর্থ মন্ত্রণালয়ের ১৯৮৫ সালের একটি স্মারক বলে হিসাব মহানিয়ন্ত্রকের কার্যালয় স্থাপিত হয়। পূর্বে এটি এজি অফিস (সিভিল) নামে পরিচিত ছিল। সরকারের সাংগাঠনিক কাঠামো পরিবর্তনের অধীন হিসাব মহানিয়ন্ত্রক কার্যালয় প্রতিষ্ঠার পর ৬৪ টি জেলা হিসাবরক্ষণ অফিস (বর্তমানে ‘জেলা একাউন্টস এন্ড ফিন্যান্স অফিস) এবং ৪০০ টি উপজেলা হিসাবরক্ষণ অফিস (ইউএও) সৃষ্টি হয়। একইসঙ্গে বিভিন্ন প্রশাসনিক মন্ত্রণালয় বা বিভাগের জন্য ঢাকায় ২০ টি প্রধান হিসাবরক্ষণ কর্মকর্তার কার্যালয় (বর্তমান ‘চিফ একাউন্টস এন্ড ফিন্যান্স অফিস) সৃষ্টি করা হয়। বর্তমানে মোট ৫০ টি চিফ একাউন্টস এন্ড ফিন্যান্স অফিস বিভিন্ন মন্ত্রণালয় বা বিভাগের জন্য কাজ করছে। এরই ধারিবাহিকতায় হিসাবরক্ষণ ব্যবস্থা শক্তিশালী করার জন্য সিএএফও/বাংলাদেশ সুপ্রীম কোর্ট কার্যালয় প্রতিষ্ঠা লাভ করে। প্রতিষ্ঠালগ্ন থেকে এটি আর্থিক কার্যবলী সুচারুরূপে সম্পন্ন করার মাধ্যমে হিসাবব্যবস্থা শক্তিশালী করে এবং গতিশীলতা নিয়ে আসে। এই অফিস বর্তমানে সেগুনবাগিচার হিসাব ভবনের ৫ম তলায় অবস্থিত। অফিস প্রধান ‘চিফ একাউন্টস এন্ড ফিন্যান্স অফিসার’ জাতীয় বেতন স্কেল, ২০১৫ অনুযায়ী একজন গ্রেড-৫ পর্যায়ের কর্মকর্তা।